成立：創立於1880年，1995年董事會籌設醫學院，結合臨床、研究與教學能力，培育富有關懷弱勢、尊重生命的醫療專業人才，提供全人醫護教育訓練。2009年經教育部通過，招收首批學生。
宗旨：致力於醫療傳道，近年發現基礎研究及教學支援不足，影響臨床服務及人員熱情。因此，董事會於1995年籌設醫學院，結合臨床、研究及教學能力，培育關懷弱勢族群之醫療專業人才。以基督信仰為基礎，提供學生全人醫護教育訓練。
熱門學系：醫學系、護理學系、聽力暨語言治療學系、視光學系
優勢：以馬偕紀念醫院的臨床醫療、研究與教學能力為基礎，提供學生全人醫護教育訓練，以最優質的教學設備、課程規劃、師生比例、學習資源等，培育具有嚴謹治學理念及照顧弱勢精神的醫療專業人才，致力成為世界級大學之一。此外，醫學院也擁有1.5公頃的自然森林，提供學生一個優美的學習環境。
招生方式:繁星、甄選、申請入學、登記分發
於分子醫學研究所培育研究生具備分子生物醫學的核心知識，進一步能夠應用於基礎或臨床之研究。
教育目標包括提供學生完整的分子生物學、細胞生物學、生物化學、藥理學等基礎學科之課程，並進行前沿之生物醫學研究。
同時，還強調學生培養自主學習、獨立思考、團隊合作、溝通表達、倫理規範等核心能力，以提升學生的綜合素質和競爭力。
高齡福祉科技研究所致力於培養跨領域高齡照護人才，整合生命科學、臨床醫學、生活科技、工程技術等研究領域
建立優質應用研究與教學模式，並推動產業技術應用，發展具全球競爭力之高齡人口照護產業。
馬偕醫學院護理學系注重結合學理與實務，培育護理專業能力與學養。提供多元學習機會，結合馬偕醫療體系
啟發學生國際觀念及多軸度學習，協助職涯發展。護理學系的使命是培育具台灣與國際競爭力之護理人才。
馬偕醫學院長期照護研究所，傳承馬偕精神，以跨領域團隊之健康照護理念為主軸，培育具國際宏觀之實務人才
結合臨床醫療、研究與教學能力，提供完善且優質的教育，以培育尊重生命的長期照護專業管理人才，並吸引相關領域之學生，以協助解決世界人口老化及少子化之議題。
馬偕醫學院聽力暨語言治療學系的目標是在深具人文關懷、照顧弱勢族群的「馬偕精神」優良傳統和使命下，同時提供學術理論基礎和臨床技能的培養。
該系所在的馬偕紀念醫院擁有優秀的小兒科醫護團隊，以及台灣新生兒聽力篩檢的先驅——耳鼻喉科，而台北和淡水院區的臨床聽語中心擁有專業人員和相關設備
因此該系所提供的兒童聽力、語言和聽覺口語方面的教學和臨床訓練都具有深厚和完整的基礎。
評價與評論